美國聯(lián)邦調(diào)查局探員福克斯·穆德（大衛(wèi)·杜喬夫尼飾）童年時(shí)經(jīng)歷了一起奇怪而神秘的綁架案。他的妹妹薩曼莎在睡夢(mèng)中被外星人綁架，至今下落不明。此后，穆德專注于神秘事件的研究，并專門負(fù)責(zé)聯(lián)邦調(diào)查局總部的X檔案部。因?yàn)槟碌滦袨榉闯?，難以控制。聯(lián)邦調(diào)查局高級(jí)管理層從聯(lián)邦調(diào)查局學(xué)院調(diào)來了女特工黛安·肖利（吉莉安·安德森飾），表面上是為了協(xié)助穆德的工作，但實(shí)際上希望這位崇尚科學(xué)的理性特工能夠限制穆德的行為。兩人最初的合作并不理想，完全不同的思維模式總是導(dǎo)致爭(zhēng)議的爆發(fā)。然而，隨著各種離奇案件的出現(xiàn)和他們的聯(lián)系的加深，穆德和斯克利最終成為了可靠的伙伴，他們可以為彼此經(jīng)歷生死。。。這部電影在1996年至1999年美國作曲家、作家和出版商協(xié)會(huì)電影和電視音樂獎(jiǎng)的電視劇中獲得第一名，并在其他電影節(jié)中獲得近70個(gè)獎(jiǎng)項(xiàng)。