SIDE6沉浸在和平祥和的氣氛中，遠離戰(zhàn)場，那里幾乎從未發(fā)生過戰(zhàn)爭，駐扎在這里的聯(lián)邦軍隊也不多。這并沒有讓年輕的阿魯感到高興，因為他是一個軍事愛好者，渴望看到激烈的戰(zhàn)斗場面。一天，當阿魯和他的朋友們交流時，殖民地發(fā)生了騷亂，這是吉恩的小型偵察部隊和聯(lián)邦之間的沖突引起的。不久之后，一名受傷的扎克從阿魯上空飛過，降落在附近的森林草坪上。被擊落的吉恩新兵巴尼用他的軍銜徽章?lián)Q了阿魯?shù)南鄼C磁卡，磁卡記錄了阿魯從聯(lián)邦工廠抵達的MS組裝鏡頭。此外，還有一張克里斯的美麗照片，他是幾天前從地球搬來的阿魯一家的鄰居。巴尼獲得的情報引起了吉恩軍隊的注意，他們立即組成突擊隊執(zhí)行摧毀戈達的任務。于是，巴尼的團隊依靠一場小規(guī)模戰(zhàn)斗的混亂，再次潛入SIDE6。在宇宙殖民地，巴尼再次見到了阿魯。渴望成為MS飛行員的Young Aru自愿為基因突擊隊偵察聯(lián)邦軍秘密基地的位置，并與監(jiān)視他的年輕人Barney成為朋友。一天，巴尼在阿魯?shù)拇皯粝掠龅搅丝死锼梗@給巴尼的監(jiān)視任務帶來了一絲樂趣。與此同時，在突擊隊的秘密倉庫里，柯達公司使用的新MS Kampuma正在組裝中，計劃在圣誕節(jié)前完成摧毀亞歷克斯的任務。在所有的準備工作完成后，高達戰(zhàn)役的毀滅開始了。由吉恩的一名老兵駕駛的Kampuma號將駐扎的聯(lián)邦部隊打得落花流水，并與突擊隊合作，迅速抵達停在亞歷克斯的秘密工廠。亞歷克斯NT-1迅速做出回應，以表現(xiàn)優(yōu)勢擊敗了坎普馬。此時，吉恩的突擊隊在戰(zhàn)斗中失敗了，除巴尼外，所有隊員都犧牲了。吉恩的突擊隊行動失敗后，該隊唯一的幸存者巴尼接到指令，立即撤離SIDE6。由于吉恩軍隊沒有機會組織力量摧毀戈達德，他們計劃在圣誕節(jié)前夕使用核彈摧毀整個太空殖民地。得知消息后，巴尼要求阿魯立即通知家人和克里斯盡快離開殖民地，但遭到阿魯?shù)姆磳?。阿魯希望他出色的車手巴尼能夠擊敗亞歷克斯，拯救殖民地的命運，所以巴尼不得不獨自離開。警方不敢相信阿魯?shù)膱蟾?，對其置之不理。與此同時，載有吉恩軍隊核彈頭的攻擊艦已離開母船。面對他的朋友和家人，阿魯幾乎感到絕望。在機場，巴尼在猶豫。最后，他決定為阿魯、他心愛的克里斯和殖民地的人民向亞歷克斯發(fā)出最后的挑戰(zhàn)。在阿魯?shù)膮f(xié)助下，他修復了在第一次攻擊SIDE6時被擊落的扎克，并用他唯一的武器——能量斧對NT-1發(fā)動了攻擊。與此同時，阿魯從父親那里得知，吉恩軍隊將在幾天后簽署最終的作戰(zhàn)協(xié)議。他向巴尼戰(zhàn)斗的地方跑去，但面前那把破碎的NT-1光束劍已經刺穿了扎克的駕駛艙。而被救護人員從NT-1駕駛艙救出的聯(lián)邦飛行員那一頭美麗的紅發(fā)更是讓阿魯目瞪口呆